Setelah Operasi Pemusnahan Keluarga Tsukiyama berakhir, anggota Komisi Penanggulangan Ghoul (CCG) telah tumbuh secara eksponensial dalam kekuatan dan terus mengejar tujuan mereka untuk membasmi setiap ghoul di Jepang. Setelah mengundurkan diri dari Quinx Squad, Haise Sasaki yang sekarang tampak tanpa emosi mulai mengambil lebih banyak tugas dari CCG tanpa mempedulikan kesulitannya. Meskipun ekspresinya kosong, ingatan Ken Kaneki muncul kembali di Haise, membuatnya dalam keadaan konflik internal. Sementara itu, perilakunya yang baru dan dingin memengaruhi orang-orang di sekitarnya. Quinx Squad dibiarkan berantakan, harus menghadapi kematian salah satu anggota mereka tanpa dukungan dari mantan mentor mereka.
Di tengah kekacauan ini, baik Quinx Squad maupun Haise harus terus memenuhi tugas mereka kepada CCG, baik dengan sukarela maupun tidak. Namun, keberadaan kelompok misterius di balik CCG telah diketahui oleh Haise, dan bisikan-bisikan tertentu tentang korupsi juga tidak luput dari perhatian Quinx Squad.
