Enam bulan yang lalu, Sakuta Azusagawa bertemu secara kebetulan dengan seorang gadis kelinci di perpustakaan. Sejak saat itu, ia bahagia dengan pacarnya: Mai Sakurajima, gadis kelinci yang sama. Namun, kemunculan kembali cinta pertamanya yang misterius, Shouko Makinohara yang kini telah dewasa, menambah kerumitan baru dalam hubungannya dengan Mai. Lebih buruk lagi, ia kemudian bertemu dengan Shouko anak SMP di rumah sakit, yang menderita penyakit parah. Secara misterius, bekas luka lamanya mulai berdenyut setiap kali ia berada di dekatnya.
Dengan situasi aneh Shouko yang entah bagaimana berputar di sekelilingnya, Sakuta harus berdamai dengan perasaannya sendiri yang saling bertentangan, baik atau buruk. Dengan kehidupan seorang gadis di tangannya, apa yang bisa ia lakukan?
