Sindrom Pubertas yang langka dan tidak dapat dijelaskan dianggap sebagai mitos. Ini adalah penyakit langka yang hanya menyerang remaja, dan gejalanya sangat supranatural sehingga hampir tidak ada yang mengenalinya sebagai kejadian yang sah. Namun, siswa SMA Sakuta Azusagawa tahu dari pengalaman pribadinya bahwa itu sangat nyata, dan kebetulan cukup umum di sekolahnya.
Mai Sakurajima adalah siswa SMA tahun ketiga yang mendapatkan ketenaran di masa mudanya sebagai aktris cilik, tetapi baru-baru ini menghentikan kariernya yang menjanjikan karena alasan yang tidak diketahui publik. Dengan sikapnya yang tidak mudah didekati, dia terkenal di seluruh sekolah, tetapi tidak ada yang berani berinteraksi dengannya—sampai akhirnya Sakuta melihatnya berkeliaran di perpustakaan dengan kostum gadis kelinci. Meskipun mengenakan kostum itu, tidak ada yang memperhatikannya, dan setelah menghadapinya, dia menyadari bahwa Mai adalah korban lain dari Sindrom Pubertas. Saat Sakuta mencoba membantu Mai melewati kesulitannya, tindakannya membuatnya berhubungan dengan lebih banyak gadis yang menderita penyakit yang sulit dipahami itu.
